При таком сомнительном раскладе (ни одна примета не совпадает с личностью Александра) оперативники и следователь проявили настойчивость, а задержанный Цветков без квалифицированной защиты не смог противостоять. На исходе первых суток следствия он начал давать нужные для следователя показания об обстоятельствах преступления, о которых он узнал на очной ставке с Алешиным, а уже через час отказался от этих показаний. Близкие считают, что на него было оказано давление, он был усталым после командировки, бессонной ночи, перелёта, холода (из самолёта его вывели без верхней одежды, а в Москве в тот день было минус 9 градусов). Определённую роль сыграли шок от случившегося и нервное перенапряжение. Но потом он опомнился и заявил, что оговорил себя под давлением следователя и сотрудников уголовного розыска.
По версии следствия, утром 2 августа 2002 года, Цветков вместе с подельником Алешиным с особой жестокостью убил пожилого мужчину в деревне Городище Московской области, а затем они зверски расправились с женщиной в Москве. В первом случае, по версии следствия, Цветков действовал «из чувства личной неприязни на фоне распития спиртных напитков», во втором — корысти ради, «получив от неустановленного лица информацию о том, что в квартире содержаться ценности и деньги».
10 августа жертвами якобы Цветкова и Алешина стали две женщины, одна из которых 1909 года рождения, вторая 1946 года рождения. По версии следствия, оба мужчины в период с 00.00 до 23.59 находились в квартире дома на Ярославском шоссе, где проживали мать и дочь. После совместного распития спиртных напитков, «испытывая личную неприязнь, а также действуя из корыстных побуждений» Цветков и Алешин задушили их. При этом преступники забрали 5 тысяч рублей, золотые сережки и кольцо.
После признания и ареста (18.02.2023) следствию Цветков абсолютно стал неинтересен. Адвокат пытался возражать, ведь под приметы отец не подходит, но все это игнорировалось и судьёй, и прокурором. Вот основные несоответствия: наличие татуировок у убийцы (у Александра никогда татуировок не было). Кроме того, он никогда не курил, а все свидетели указывают на человека, выкуривающего по полпачки сигарет в день. Ни одна примета свидетелей не совпадает с портретом Цветкова. Один свидетель утверждает, что убийца ростом 185, светло-русый с голубыми глазами, другой утверждает, что 160 и жгучий брюнет с карими глазами. Что Александр ростом 174 с зелёными глазами, следствие не волнует. Они, видимо, взяли по средней.
Только после суда узнав даты убийств, какие вменяют Александру в вину (02.08.2002 и 10.08.2002), родственники обратились в архив ИБВВ РАН, где чудом сохранились приказы об экспедициях, командировках, лицевой счёт. Из этих документов выходит, что 10.08.2002 он был в экспедиции в Ивановской и Вологодской областях, есть даже фотография, сделанная на паромной переправе именно 10 августа. 1 августа он был в экспедиции, возвратился в Борок в 16:00 и никак не успел бы оказаться в Москве за 2 часа (его видели свидетели обвинения в 18:00 1 августа, а само убийство произошло 2). Все документы, подтверждающие алиби на руках у следствия с 21 февраля. Свидетели, которые тогда были с ним, приезжали на допрос 12 апреля по собственной инициативе, не дождавшись, когда их пригласят, и подтвердили алиби. Более того, при обследованиях у него обнаружили аневризму, что говорит о том, что он перенёс инфаркт (16 февраля, скорее всего).
Ирония судьбы. В 2022 году отец стал призёром конкурса "Лучший папа Золотого кольца" в номинации "Есть такая профессия" (в этом году он уже "научный Чикатило"). Он не только любящий отец троих дочерей, но и увлечённый своим делом учёный. Каждое лето он преподаёт гидрологию детям в детской эколого-краеведческой экспедиции " Мы - дети Волги", где приобщает десятки детей к науке, рассказывает о ней с интересом, так, что многие дети становятся биологами и экологами. Кроме того, в местной школе (в нашем посёлке) он многократно проводил занятия по прикладной гидрологии, рассказывая детям обо всех тонкостях.
В 2021 году семья Цветковых стала призёром конкурса "Семья года".
Об алиби и свидетелях, подтверждающих это алиби, заявлено защитой давно, ещё в феврале, на 3-й день ареста. Очередной суд по непонятной причине не принимает это во внимание. Следователь предоставил суду протоколы допросов свидетелей не в полном объеме, а только первую и последнюю страницу. На вопрос защиты, где непосредственно материалы допроса, ведь суд обязан знать все аспекты дела, судья Терехова А. А. заявила, что, оказывается, следователь вправе предоставить материалы на своё усмотрение, те, которые хочет и в том объеме, в котором хочет. А мы-то думаем, что суд должен быть справедлив и беспристрастен и учитывать все обстоятельства дела. Если есть алиби, свидетели, характеристики подозреваемого, несоответствие примет подозреваемого с тем, что говорят свидетели. Получается, что всё, что представляют адвокаты, это суд не учитывает, а придерживается только стороны обвинения. А обвинение основывается на показаниях рецидивиста. Кстати, суд почему-то начался на полчаса раньше, почти исключив возможность присутствовать на суде коллег подозреваемого и журналистов. Так боялись, что будет пресса? И об опасности Цветкова. Человек 20 лет спокойно жил, трудился, воспитывал детей, приносил пользу стране, продвигал российскую науку, в том числе и для детей и вдруг с 16 февраля стал резко опасен для общества. Защитой на этом суде было зачитано около десятка положительных характеристик Цветкова и около 30 грамот, которые он получил за эти 20 лет. Почему, учитывая состояние здоровья, алиби и скользкую позицию обвинения, суд не разрешил домашний арест? Судья нашла доказанным факт того, что Цветков А. И. может скрыться, оказывать давление на свидетелей, при отсутствии хоть одного такого доказательства. И при всём при этом - ни одного следственного действия с 18 февраля с участием Александра. Теперь впереди у Цветкова психоло-психиатрическая экспертиза в стационаре Сербского».
